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genetic and genomic medicine
189 件の論文
Genetic loss of JAK1 and cutaneous HPV infection
本研究は、JAK1 遺伝子の機能喪失変異が、先天性免疫異常症「表皮異形成症」の発症や皮膚 HPV 感染への感受性、および非黒色腫皮膚癌のリスク増大をもたらすことを、4 つの家系における遺伝子解析と機能評価を通じて明らかにしたものである。
Epigenetic Signatures in Monozygotic and Dizygotic Twins Discordant for Orofacial Clefts
この研究は、口唇裂・口蓋裂（NSCL/P）の発症に環境要因が関与する可能性を示唆し、一卵性双生児と二卵性双生児の不一致ペアを用いたエピゲノムワイド関連解析により、レチノイン酸代謝やクロマチン調節に関わる遺伝子領域のメチル化変化を同定した。
Combined analysis of chromatin accessibility, promoter interactions and whole genome sequencing solved the missing heritability in gastric cancer
全ゲノムシーケンシングにクロマチンアクセシビリティやプロモーター相互作用解析を組み合わせることで、CDH1 遺伝子制御領域や MLH1 遺伝子座における新規の欠失変異、および粘液タンパク質や免疫関連遺伝子に影響する寡遺伝子的な欠失パターンを同定し、遺伝性びまん性胃がん（HDGC）様家系の 47% において「見えない遺伝性」を解明しました。
Leveraging Open-Source Large Language Models to Identify Undiagnosed Patients with Rare Genetic Aortopathies
この論文は、臨床ノートから遺伝性大動脈疾患の未診断患者を特定し遺伝子検査を推奨するために、検索拡張生成（RAG）技術を活用したオープンソースの大規模言語モデル（LLM）パイプラインを開発し、Penn Medicine BioBank のデータを用いた検証で高い精度を達成したことを報告しています。
Considering social risk alongside genetic risk for bipolar disorder in the All of Us Research Program
アロ・オブ・ユー研究プログラムの大規模コホートを用いた本研究は、双極性障害の遺伝的リスクスコアよりも社会環境的リスク要因（ストレスや小児期の逆境など）の方が疾患リスクの説明力が大きく、両者を統合したアプローチがより公平で正確な精神疾患リスク予測に不可欠であることを示しています。
Multiplex Portuguese Families as a Lens into rare mutations and the Shared Genetic Architecture of Schizophrenia, Mood Disorders, and Autism Spectrum Disorders
ポルトガルの島嶼集団に由来する 173 組の多発家族の解析により、CHD2 遺伝子の機能喪失変異が統合失調症、気分障害、自閉症スペクトラム障害など、異なる精神疾患の表現型に共通して関与する稀な大効果変異であることが示され、このアプローチが精神疾患の生物学的メカニズム解明や新規治療標的の発見に有望であることが明らかにされました。
Ancestry-stratified variant classification in monogenic diabetes genes: annotation coverage and differential curation burden
単一遺伝子性糖尿病の 17 遺伝子における ClinVar と gnomAD の解析により、非ヨーロッパ系集団では変異の注釈カバレッジが約 70% 不足しており、これが単なる VUS（意義不明変異）の増加ではなく、カバレッジの欠如とcurration（審査）の不足という構造的な公平性の問題であることを明らかにしました。
Proteogenomic analysis of 5,411 plasma proteins in sickle cell disease patients
この研究では、343 人の鎌状赤血球症（SCD）患者の血漿タンパク質を網羅的に解析し、560 のタンパク質量形質遺伝子座（pQTL）を同定するとともに、Mendelian 無作為化解析を通じて胎児ヘモグロビン産生を増加させる可能性のある 5 つのタンパク質を特定しました。
Religious beliefs and practices, political orientation, and distrust in healthcare predict attitudes toward mRNA vaccines in the United States
米国成人を対象とした大規模調査の結果、エヴァンジェリカル・プロテスタントは mRNA ワクチンへの支持が低く無神論者が最も高い傾向にあること、またワクチンへの態度は政治的志向、医療システムへの不信感、宗教的信仰や実践、および遺伝子知識などの要因によって強く予測されることが明らかになりました。
Pitfalls in estimating and interpreting the contribution of ultra-rare genetic variants to the heritability of complex traits
この論文は、UK バイオバンクのデータを用いた理論・シミュレーション・実データ分析を通じて、人口層化や非加法的遺伝効果、正規分布からの逸脱などが超希少変異（特にシングルトン）に基づく複雑形質の遺伝率推定にどのようなバイアスを引き起こすかを明らかにし、これらの交絡要因を補正した上で特定の形質における有意な遺伝率を報告するとともに、より信頼性の高い推定に向けた今後の課題を提起しています。
A non-coding variant at 2p24.2 confers susceptibility to non-syndromic cleft lip and palate through LLPS-dependent regulation of MYCN
この研究は、非症候性口唇口蓋裂の主要なリスク遺伝子座 2p24.2 において、非コード領域の変異が転写因子 FOXP2 の液 - 液相分離を阻害し、MYCN の発現を低下させることで口唇口蓋裂の発症リスクを高めるという新たな分子機構を解明したものである。
Implementing Reproductive Carrier Screening to Include Diverse Asian Populations: Insights from Singapore
シンガポールでは、アジアの多様性に特化した 112 遺伝子パネルを用いた全国規模の生殖キャリアー検査プログラムを導入し、コミュニティや宗教指導者との関わりを通じて文化的に適切な実施を推進する初期段階の成果と課題を報告しています。
Shared Genetic Architecture Between Kidney Function and Alzheimer Disease Across Ancestries
この研究は、多祖先集団を対象とした大規模遺伝解析により、腎機能とアルツハイマー病の間にゲノム全体の相関はないものの、APOE など特定の遺伝子座において垂直的および水平的な多面性を通じて複雑な遺伝的共有構造が存在し、特に APOE 遺伝子座のみが異なる祖先集団間で共通していることを明らかにしました。
DNM1-related disorder is characterized by recurrent variants and phenotypic homogeneity
本研究は、DNM1 関連疾患の最大規模のコホート解析を通じて、疾患の遺伝子型と表現型の均質性、特定の再発変異と臨床特徴の相関、および標的治療開発の有望性を明らかにしました。
PAVS: A Standardized Database of Phenotype-Associated Variants from Saudi Arabian Rare Disease Patients
サウジアラビアの希少疾患患者に特化したゲノム・表現型データベース「PAVS」が開発され、多様なコホートと文献データを統合して表現型に基づく遺伝子優先順位付けの精度を向上させ、過小評価された集団における変異解釈のギャップを埋めることが示されました。
Mutation-specific impairment of TET2 and DNMT3A enzymatic activity predicts clonal hematopoiesis disease risk
TET2 および DNMT3A の変異がもたらす酵素活性の低下度をメチル化パターンから定量化するスコアを開発したことで、クローン性造血（CHIP）患者の疾患進行リスクをより高精度に予測し、個別化されたリスク層別化が可能になった。
Comparing Cardiac Genetic Testing Pathways: Impacts on Access, Informed Choice, and Decisional Satisfaction
心臓科における遺伝子検査の主流化はアクセスと待機時間の改善をもたらしましたが、医療遺伝科のウェビナー参加者に比べて患者の意思決定における情報理解度が低かったため、主流化モデル内での構造化された教育の重要性が示されました。
A complex duplication overlapping FBRSL1 implicated in a developmental and epileptic encephalopathy
本研究は、FBRSL1 遺伝子の複雑な重複変異がドミナントネガティブ機構により引き起こされ、これまでに報告された症例よりも重篤な発達・てんかん性脳症を呈する初例を報告し、FBRSL1 関連疾患の遺伝的および表現型のスペクトルを拡大したものである。
Berrylyzer-an Efficient, Traceable, and Lightweight Intelligent Agentic System for Prenatal Genetic Diagnosis
本論文は、臨床医の推論プロセスに着想を得たモジュール型スコアリングアーキテクチャを採用し、構造化オントロジーと自由記述の両方の臨床情報を統合して先天的遺伝性疾患の診断を効率化・高精度化する新しいAI駆動型変異優先順位付けシステム「Berrylyzer」を開発し、既存の主要ツールを上回る性能を実証したことを報告しています。